序号 | 采购内容 | 数量/单位 | 预算单价 | 品牌 | 型号 | 规格参数 | 质保及售后服务 | 附件 |
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* | 线粒体***甲基化及拷贝数检测 | */项 | 技术服务 | 技术服务 |
委托方(甲方)提供***例血液样本,由受托方(乙方)完成***例血标本的线粒体***(*****)甲基化检测,***例血标本的*****拷贝数检测及测序数据的数据整理及分析,技术内容如下:
*.***提取、***浓度检测、***完整性检测和全血样本的保存;
*.引物设计:对目标序列/位点进行靶向区域甲基化*****设计(****** ******** *****),扩增子长度*般为***-*****长度范围;
*.测序:测序策略为*****测序。拷贝数检测每个样本获得不少于*.*** *** ****数据(该数据量为***数据,在总数据量达标的情况下,每个样本数据量不低于目标数据量的**%,测序平均***≥**%,平均***≥**%);甲基化检测平均深度****;
*.线粒体***甲基化检测信息分析:
*)去接头污染,去低质量*****和产量情况统计;*)*********信息采集序列与参考基因组目标序列的比对;*)*碱基深度和覆盖度分析;*)*碱基的甲基化水平统计;*)不同样本间基因甲基化水平比较;
*.线粒体***拷贝数检测信息分析:
*)原始数据质量评估;*)原始数据********;*)***** ***** 质量评估;*)参考基因组比对情况统计;*)拷贝数变异(***)分析;*)参考序列物种:****
*.技术要求:
*)***提取、***浓度及完整性检测(硅胶层析柱法进行***提取;***** ***********检测***浓度;琼脂糖凝胶电泳法检测***完整性);样本的保存:根据血样原有**号,对所提取的***进行编号,确保***编号与血样编号**对应。检测不合格的样品,需要保存在-**℃,保存好**号,做好记录,并在*个工作日内通知甲方,与甲方沟通存在的问题;*)*****甲基化检测:乙方对甲方确定的靶向区域进行基于****** ******** ****** *****系统的亚硫酸盐测序***引物设计,结合高通量测序进行检测,每个样本的位点/区域测序平均深度不低于****;*)*****拷贝数检测:每个样品进行质检及全基因组测序(***** ****** **********, ***)文库构建 对质检合格的样本基因组***进行***建库, 样本基因组经超声片段化,***片段主峰在***-*****范围,对应文库大小主峰在***-*****主峰范围。然后进行末端修复,接头连接,最后进行***扩增;*)乙方在甲方筛选确定的基因启动子区域进行***引物设计合成及验证
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*. 甲方提供的样品不合格时,乙方应在*个工作日内与甲方进行沟通,甲方在*个工作日内进行样品的及时更换。
*. 如因乙方过错导致项目迟延时,乙方应及时与甲方沟通,乙方应承担违约责任,乙方除继续履行合同外,还应支付违约金,违约金为已支付金额的**%。
*. 乙方需对涉及本合同的技术文件、资料信息、检测结果等进行保密,保密期限为合同有效期及合同终止后*年内。泄密方承担因此给信息提供方造成的损失,并支付本项目总费用金额的**%作为违约金。
*. 如因乙方过错导致项目失败、合同被解除时,应当支付本项目总费用金额的 **% 作为违约金,还应在合同解除之日起**个日历日内返还甲方已经支付的合同款。
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