深圳大学 - 竞价公告 (CF105902024001069)
招标公告 深圳大学 - 竞价公告 (CF105902024001069)
更新时间 2024-09-03
关键词
广东省   甲基化
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基本信息:
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液相探针捕获甲基化测序
*.具备文库构建测序平台,包含但不限于各类测序仪器。 *.具有分析平台,具备独立服务器,可进行液相探针捕获甲基化测序数据分析,可进行多组学数据联合分析。 *. 液相探针捕获甲基化测序技术要求: *.*提取***血浆中的*****样本,使*****总量满足建库要求。 *.*使用液相探针捕获甲基化测序技术,针对**例*****样本进行全基因组范围内***岛、启动子等靶区域的液相游离探针捕获,并完成甲基化测序; *.*使用超级计算机进行测序数据过滤,并使用超级计算机分析流程进行生物信息学分析,筛选得到实验组和对照组之间的差异甲基化区域。 *.*生物信息分析要求:*.甲基化测序数据获取;*.数据质控:计算原始数据的质量(***和***),去除接头,去除低质量碱基和*****;*.数据分析:*碱基深度和覆盖度分析,*碱基的甲基化水平和测序深度统计;*.差异分析:不同组之间差异甲基化位点或者区域分析;*.其他后续定制个性化分析,包括***注释、**、****功能富集分析等; *. 液相探针捕获甲基化测序交付指标: *.*文库构建,对样品进行质检及甲基化液相探针捕获建库,对提供的血浆样本进行*****提取质检,合格后通过液相游离探针捕获靶向区域,回收目的片段进行重亚硫酸盐测序 为保证测序数据质量及分析效果,承诺以检测到基因组上的***位点为内参进行评估*********转化率不低于**%。 *.*测序产量,测序平台为********平台,策略为*****,每个样本获得不少于 ** *** ****数据 (该数据量为甲基化数据,不包含平衡文库数据,在总数据量达标的情况下,每个样本数据量不低于目标数据量的**%,测序碱基质量值平均***≥**%,平均***≥**%)。 *.*生物信息分析要求: *) 测序数据质量评估 *) 数据比对分析及评估 *) 甲基化位点检测及分析 *) 全基因组甲基化图谱 *) 样本间(组间)甲基化水平比较分析 *) 差异甲基化分析 *)其他任何个性化分析 *.全基因组遗传关联分析芯片测序数据的知识产权归深圳大学所有。
*、验收合格之日起,免费售后服务*年; *、 技术问题解答:投标人提供免费解答项目中所涉及的任何有关上述模型定制、合成、测序、产品制备等所有该项目涉及的过程中产生的技术问题、数据分析等内容,不再另收取其他任何有关该项目的费用。若有必要,收到采购人通知**小时内,投标人需到现场进行指导培训或解答技术问题。 *、 咨询、投诉响应时间:项目进行过程中***小时内指派合格的技术人员进行回复,其他无法迅速解决的问题,*周内解决或提出明确解决方案;采购人收到结果**小时内,发现该项目的任何问题,投标人需要将在**小时内给出解决方案,优先满足采购人实验需求。 *、 售后支持:要求投标人具有完善的售后服务队*,及时响应采购人的服务要求。 *、 质量担保:要求所有提供的产品及检测技术均符合行业有关标准进行生产、检验合格的产品或技术,能完全满足采购人的技术要求。
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